Re: [問題] 電腦模擬蛋白質製藥的需求?

看板Bioindustry作者 (肥仔)時間10年前 (2013/11/22 16:15), 編輯推噓5(5024)
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※ 引述《ljii (是否)》之銘言: : ※ 引述《piimaila (肥仔)》之銘言: : HTS說穿了就很多很多種藥物然後讓機器人幫你作投藥跟收data的動作罷了, 所以廠商基本上是亂槍打鳥? 還是預先知道藥物範圍? : 直接拿一百萬個藥去作HTS, 有100個well裡的細胞死掉了 這樣費用大概多少, 我參考一下興大的費用 1 X 96 (每次篩選一個樣品): 新台幣 9,800 元 這樣是說 一次一個蛋白質樣品, 測試96種化合物 是不是這樣呢? 當然 做多是有優惠, 但是一次拿100萬個事不是成本非常高? 那實務上又如何縮小範圍? : 所以"僅"通過電腦篩選的都還需要進行大量的細胞和動物試驗 : 距離實際可用的資料還有很長的距離 : 以這種低期望值的資料來說, 商業價值可能不會很高 恩, 這樣 用電腦預測和用HTS的預測差在哪裡呢? 是否通過HTS預測的就不需要細胞和動物實驗? 如果 HTS一樣得通過細胞和動物實驗 這樣為啥要選擇HTS不選擇電腦篩選? 兩者之間的差距差在哪裡呢? 恩, 補問一個, 所謂的市場價值不是很高是大概一個可能性多少錢呢? 是否有交易成功的案子可以參考?.? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 172.245.16.16 ※ 編輯: piimaila 來自: 172.245.16.16 (11/22 16:52)

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電腦預測好發paper阿 換個參數 target就一篇
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電腦模擬的價值在學術上面比較大
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是一堆會結合拉, 如果無腦亂黏的話, 問題是價值何在?
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感覺上我乾脆找教授賣超級電腦比較好賺orz
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跟他們說, 喵的, 妳們買那70萬的是搞笑, 我賣妳只要半價
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然後賺3倍這樣 XD (我說的是真實案例, 不過他不是買70萬)
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其實說真的,這才是比較好的商業企劃。因為現在國科會要求
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應用性,HTS又不是像PCR machine一樣人人有。如果你們可以
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降低設備門檻然後順便代理個軟體,應該很多單位會買單。
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因為只要用你們的系統預測一些compound出來,就可以扯說
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自己的研究很有應用性,有找到有潛力成為新藥的compound..
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基本上軟體到處都找的到, 只是要針對機器特化而已
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代理的軟體用的是通用機台, 速度根本上不去
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簡單的說, 就有點像是拿萬能刀去做手牌小刀的事
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不但貴上許多, 也做不好
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如果可以做到軟體綁硬體那就更好了。
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11/24 13:27, , 17F
最廣的HTS當然是什麼都篩亂槍打鳥..但是經費、時間、
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人力有限,當然會限縮一定的範圍
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對大藥廠來說,篩個藥花個一百萬美金都不算貴
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給你算半天 他寧願花錢解決
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不要拿台灣國科會預算這種等級的錢 套用在這些大藥廠上
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基本上, 如果以10000/day來說, 目前我手頭上是2.4萬/day
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不會慢慢算...只是, 目前我學習了一下, 似乎和HTS是相輔
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相成, 傳統HTS許多做不到要靠電腦篩選, 而電腦篩選對
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濃度等控制也做不到, 要靠HTS
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oh~我補充一下 2.4萬/day是單機的運算, 沒上cluster
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10組就可以加個9~10倍沒啥問題
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當然 尚在學習中~感覺上是可做 但是問題不在速度
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在沛體受體資料庫是否準確 才是最大的盲點
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