Re: [問題] Ligation失敗(已看過精華區)

看板Biotech作者 (有氣質的台客)時間18年前 (2006/05/11 13:10), 編輯推噓5(502)
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※ 引述《ctlee (寧靜小城)》之銘言: : 請問各位高手 : 小弟現在要將3kb的PCR product接到一6.4kb的vector的Bgl II上 : 我先PCR amplify我的fragment : 純化後用Bgl II切再gel purify以去除nonspecific products : 至於vector, 我用Bgl II 切完純化後用CIAP做dephosphorylation : Ligation的時候insert:vector大約維持在5:1的比例 : 14 C overnight之後 transform到DH5alpha competent cells : 奇怪的是,我的control(無insert)沒有任何colony : 有insert的ligation 做transformation出來所得的clone全是self-ligation : 我實在無法解釋這個結果,難道insert會促進self-ligation嗎 : clone這個fragment好幾個月了都沒什麼進展,拜託各位幫忙了 pPCR product直接切可以 以BglII來說,再primer設計上面得多延伸3個nucleotide才會比較好切 -- http://0rz.net/da0PG 我的相簿.... -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.114.100.165

05/11 13:47, , 1F
推~可以參考NEB catalog上有說明BglII切點多延伸GA或TC,
05/11 13:47, 1F

05/11 13:49, , 2F
enzyme作用20小時可達>90% cleavage
05/11 13:49, 2F

05/11 23:02, , 3F
也可以先接blunt end, 成功後送sequence看primer有沒有做
05/11 23:02, 3F

05/11 23:03, , 4F
錯, 我有一次因為廠商primer做錯 而白花了好幾個月
05/11 23:03, 4F

05/12 01:59, , 5F
我也是。primer一堆deletion,做TA後才發現!
05/12 01:59, 5F

05/13 23:17, , 6F
推primers出包,真的超無言
05/13 23:17, 6F

05/15 09:57, , 7F
可以問是哪幾家廠商嘛?...很怕我也....
05/15 09:57, 7F
文章代碼(AID): #14OiTOJ8 (Biotech)
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